第一部主要介绍传奇刺客阿泰尔的故事。大体可以分为三个部分：刺客信条1 、刺客信条：阿泰尔编年史、刺客信条:血缘。
阿泰尔编年史是刺客信条1的前传，主要讲述阿泰尔的初恋。血缘是刺客信条1的后传，讲述阿泰尔与玛利亚（另一位恋人）的故事。
阿泰尔
刺客信条1
地点：以色列、叙利亚附近
时间：1191年，第三次十字军东征
在现代的某个时间，一名叫做戴斯蒙德迈尔斯的酒吧服务生被Abstergo组织绑架，对方的研究员告诉他，其实他是古代刺客宗师的直系后裔，需要分析他的DNA来提取祖先的记忆，因为他的祖先阿泰尔知道伊甸园碎片的下落，通过这种方法，Abstergo可以找到这个神器的线索。于是迈尔斯被研究员们强迫推入了虚拟机Animus之中，返回了12世纪的中东，寻找祖先阿泰尔的记忆。
在12世纪的中东，此时处于第三次十字军东征时期。阿泰尔隶属于刺客组织阿萨辛，阿泰尔奉师父之名陆续杀死了九名圣殿骑士，为的是阻止第三次十字军东征，维护和平。当阿泰尔顺利杀死九名目标后，渐渐察觉到自己已被欺骗：原来，当年有十个人找到了一块伊甸园碎片，这十人正是九名被杀的骑士和自己的师父阿尔莫林，他之所以利用阿泰尔刺杀掉九名骑士，只是为了一人独吞伊甸园碎片，然后通过这个神器控制人们的思想，实现自己独裁的梦想。得知这一切真相的阿泰尔非常震惊，他火速返回刺客总部质问自己的师父，并展开战斗，最终杀死师父，得到了部分伊甸园碎片并将其埋藏，成为刺客联盟新的首领。将刺客组织带入一个新时代。
返回到现代的迈尔斯，知道了Abstergo公司目前已经持有部分伊甸园碎片，绑架迈尔斯来此只是为了通过他找到当年被阿泰尔埋葬的碎片。并利用神器控制人类的思想，这个时候Abstergo的研究员露西也向迈尔斯表明身份，原来她是潜伏在Abstergo公司中的间谍，她的真实身份同样是刺客联盟的成员，帮助迈尔斯逃离这里。
Animus的实验结束后，迈尔斯获得了祖先的神奇能力“鹰之眼”，通过这个能力他发现了在实验室休息间的秘密。原来，在他来这里之前，已经有16位刺客后裔曾被陆续绑架来此，在实验结束后惨遭杀害，休息间墙壁上写满了他们的遗言。一切结束后，迈尔斯在露西的帮助下试图逃离。
刺客信条：阿泰尔编年史
地点：以色列、叙利亚、黎巴嫩
时间：1190年，刺客信条1发生的前一年
阿泰尔被导师阿尔莫林去寻找神器圣杯，在寻找的过程中，阿泰尔得知圣杯被藏在了沙之宫殿中。但当他千辛万苦获得了打开沙之宫殿的三把钥匙并进入时，他只发现了一个空无一物的金色箱子。
后来得知圣杯就在圣城耶路撒冷，而且正被圣殿骑士看管，阿泰尔渗入要塞，遇到了他的初恋阿德哈，得知其身份是“圣杯”并救出。
阿德哈对阿泰尔透露，刺客组织的副首领哈拉什已经被收买并叛变到圣殿骑士阵营。于是阿泰尔便准备到哈拉什的据点为组织清理门户。阿泰尔本想在杀死这名叛徒之后便带着阿德哈远走高飞，然而就在他前往完成任务的时候，阿德哈却遭到了圣殿骑士团首领巴西利斯克的绑架 追着巴西利斯克来到苏尔之后，将巴西利斯克杀死。但是，他却发现阿德哈被关在另一艘船上，而阿泰尔已经追不上了。回到岸上后，阿泰尔遥望着远处的那艘关着阿德哈的船，拼命呼喊着阿德哈的名字，发誓有一天自己一定要找到她。
数年后阿泰尔才再次找到阿德哈，但为时已晚。阿泰尔杀掉了所有和阿德哈之死相关的人。阿泰尔的初恋就这样结束了。
阿德哈
刺客信条：血缘
地点：塞浦路斯
时间：1191年，刺客信条1结束后1个月
阿尔莫林死后一个月，十字军东征仍在继续，圣殿骑士在新团长——阿曼德·波查特的领导下，又计划着新的图谋，阿泰尔并不愿意坐等敌人来袭，于是决定主动向他们采取行动。阿泰尔领导了对海港城堡的袭击，在那里遇见了一位女圣殿骑士：玛利亚。
玛丽亚
阿泰尔制服玛利亚后，从她口中得知，圣殿骑士准备前往塞浦路斯，阿泰尔把玛利亚作为囚犯带着，一起到了塞浦路斯，希望能够用玛利亚当诱饵来吸引圣殿骑士出来。当玛利亚从阿泰尔手中逃脱后，立马就去找团长波查特，警示他有个刺客来到了这里。但波查特并不领情，认为女人不值得信任，于是下令把玛利亚关起来。阿泰尔现身救下玛利亚，但她指责阿泰尔，认为自己被怀疑都是他的错。
在阿泰尔四处探查圣殿骑士的过程中，玛利亚数度企图逃跑。虽然她对阿泰尔充满敌意，但其实阿泰尔真诚的话语渐渐在她心中产生了影响，直至她看到圣殿骑士的暴行，就对原先的信念产生了动摇。玛利亚打扮成舞女混进城堡见团长波查特的手下之一，向他质疑圣殿骑士夺取伊甸苹果的意图。对于通过奴役人民来产生秩序的行为，她不能认同。
玛利亚带着阿泰尔进入了档案室，迎战圣殿骑士团长波查特。波查特解释道，由于伊萨克（曾经的塞浦路斯皇帝）的愚蠢，让狮心王理查占领了塞浦路斯，圣殿骑士不得不再把这个岛给买回来，以避免被理查发现秘密。而他们早已在阿泰尔赶来之前把档案馆里的宝物与秘密转移了。杀死波查特之后，阿泰尔与玛利亚一起逃离档案室。玛利亚表示她正式退出圣殿骑士组织。
阿泰尔与玛利亚一起离开塞浦路斯。1193年，阿泰尔和玛利亚在利马索尔结婚。在回到马西亚夫后，他们的大儿子达里姆出生。两年后，第二个儿子瑟夫出生。
结语
回顾《刺客信条》第一部我们可以看到阿泰尔传奇的一生，他从根本上改变了刺客组织的行事方式，带领着刺客组织繁荣发展，影响了包括艾吉奥·奥迪托雷在内的很多刺客。但阿泰尔人生中两度失去挚爱，孤独地活到90多，其传奇般的一生，背后也有着无尽的痛苦折磨。