背景故事：
游戏内分为2大阵营：一是只为第三世界服务的潜伏者雇佣兵，他们身上流淌的都是野性的血液，他们只服务于弱小国家，甚至从事恐怖袭击，二是以维护和平正义为名义的保卫者佣兵，他们服务于强国，宣扬正义的立场，但是他们从来不透露每场战斗的具体，所以他们所谓的“正义”遭到了越来越多人的质疑，
潜伏者
保卫者
在小国反抗大国想操控世界的格局背景下，保卫者与潜伏者在世界各地展开了数不清的激烈战斗，但是保卫者背后有大国撑腰，胜利的天平也逐渐向保卫者倾斜，当双方打到白热化阶段的时候，潜伏者研制出了可以改变战争结局的武器，那就是生化模式的起源---生化病毒。
生化变异怪物
当然在这个时候保卫者肯定不会坐以待毙，他们决定主动出击，但是潜伏者研制的武器的威力已经超出了他们的控制，大量的潜伏者被感染了，其中最经典的就是次级幽灵，他们就是潜伏者奥摩被感染后形成的。保卫者情报指出，潜伏者被病毒反噬后却还是在老巢进行生化研究，而这次研究的是结合人类与动物基因的变异怪物，但是具体情况却没有，并且再也没有收到过第二条情报，情报人员估计已经遇害。为了从根本上解决这次生化危机，保卫者拟定了一场突袭潜伏者军营的作战计划，并且派遣了一支精英部队来到了漫天黄沙的神秘营地。
神秘营地
来到营地后，空无一人，在巡查时，一波波的生化幽灵出现了，这是保卫者才明白，他们不是猎人，他们是猎人眼中的猎物而已。就在保卫者扛过一波波幽灵攻击的时候，boss巨锤兽出来了，原来这就是情报中的变异怪物，在激战过后，保卫者逃出了神秘营地，并且报告给了总部，保卫者很清楚，这种生化怪物将会是未来最大的威胁。时间没过多久，在米国一个大峡谷中的秘密基地被曝光，为了收集更多资料，保卫者派遣了一支精英小队前往，如果顺利的话，他们可以将资料带出来，这样就可以对抗那些怪物，在一番酣战之后，小队击溃了绝命之谷的怪物，并成功拿到了资料，就在这时，敌人援军到了，为了不让资料泄露，潜伏者释放了毒气和全部怪物。酣战后，保卫者子弹都打光了，可就在他们坚持到了出口时，魔翼龙出现了！
绝命之谷
最终，保卫者还是逃了出去，不知是报复还是什么，潜伏者带着生化武器袭击了I国水之城，仅有数小时，水之城就沦为了废墟。I国正俯在机器愤怒的情况下委托了保卫者来一探究竟，可是在生化怪物的袭击下，这座美丽的城市哪还有什么生机可言，随即，翼龙兽出现了。最终，保卫者还是杀出了重围，就在这时，一份情报指向了一个基地---瓦尔基里，在这里潜伏者似乎在运输一批神秘设备，设备很可能就是研究怪物的，就当保卫者来到这里时，确是空无一人，只剩下数不清的生化怪物，就在这时，一个物体吸引了保卫者的注意，一只魔翼龙的培养器皿，保卫者明白了，这应该就是潜伏者的研究所。
水之城
瓦尔基里
数日后，潜伏者为了报复瓦尔基里剿灭之仇，向“巨人城”释放了一个巨大的怪物“泰坦”，整座城市瞬间化为炼狱废墟，精英小队为了事情的真相，与这个可以发射导弹的怪物大战。胜利的天平终将会倾斜正义一方。
巨人城废墟
就在小队在此处搜救时发现了一个没有倒塌的剧场，并且有神秘少女的歌声，小队认为在这里有幸存者，于是就进入探查，当进入剧场之后，除了数不清的生化怪物外，其他什么也没有，就在这时，一个手持镭射炮的变异男子出现在了舞台上，于是小队跟怪物又一次陷入了苦战。
末日剧场
最终小队还是平安的冲了出来，“末日剧场”事件的发生，让保卫者决心查出这一事件的来源，他们通过太空中的卫星查到了一处发着蓝色光芒的地方，于是小队前往调查，发现了一座代号祖玛的实验室高塔，内部是螺旋状的阶梯，底部有绿色液体的水池，随着一声巨响，“天蛛”缓缓的爬了上来，小队立马又开始了异常血战。
雷霆塔
血战过后，小队通过一处传送门来到了一座毁灭的都市，大量的异形生化怪物随即涌了上来，可就在这时，一只身上镶嵌的装甲的蜥蜴解除了封印，随即在轰炸机与炮火支援的双重打击下，巨型蜥蜴被打倒，可就在这时，“炽天使”从天而降，最终小队还是杀了出去。
毁灭都市
随着炽天使的倒下，潜伏者决定撤退并搭乘直升机回到沙漠实验室，可是小队早已经锁定了它们的位置，并通过极速滑板突破最后防线“末路狂飙”，并来到了最后的基地“诸神竞技场”。
末路狂飙
诸神竞技场
诸神竞技场
为了守住基地，潜伏者放出了6只怪物，但最终还是小队胜利了。